食源性病原体对公众健康构成严重威胁。于所述转移荧光共振能量的原理,Cy3和Cy5用作荧光供体和受体基团,和外切酶III(出III)被用来改善检测信号,并且测量荧光传感器用于高灵敏度检测。病基因。Cy3标记R1和R2的DNA标记的DNA用Cy5分别形成双链R1 / R2在Cy3的激发光时,荧光的波长的激发作用由于荧光共振能量转移,Cy3被关闭以产生Cy5的荧光信号。病原体基因(大肠杆菌lacŽ基因)的存在破坏了双链R1 / R2,留下远的Cy3的Cy5,造成的Cy3荧光的恢复和从Cy5的荧光信号的降低。Exo III的作用下,Cy3和Cy5的信号变化进一步增加。优化的实验条件下,荧光信号表明在10和2000 pmol / L至检测限之间的浓度范围内的靶基因中的良好的线性关系,5.29皮摩尔/ L策略使用的比率信号检测显着减少了假阳性和假阳性检测结果的产生,并提高了检测的特异性。肠杆菌;致病菌基因;荧光共振能量转移;核酸外切酶III;基于报告的荧光生物传感器简介食源性病原体被认为是影响全球食品安全的主要问题。品中常见的致病菌包括弯曲杆菌,李斯特菌,沙门氏菌,金黄色葡萄球菌和梭状芽孢杆菌。气荚膜梭菌)和大肠杆菌[1,2]。品污染的致病菌可引起胃肠道疾病,严重的脑和内脏器官,甚至导致死亡[3],严重威胁公众健康,造成重大经济损失[4]。度敏感的病原体检测已成为确保食品安全和质量的重要手段。前,食源性通常用于检测病原体的方法包括传统的微生物试验方法[5],免疫学检测方法[6]和早期检测技术的基因[7-9 ]。测的传统方法,不仅使用复杂,时间长了,也很敏感,不能满足当前的粮食安全和早期检测的要求。测核酸的病原性细菌的特定序列是极其重要的和简单的检测方法,快速,灵敏和准确的致病基因的发展成为研究[10]的一个热点。温扩增策略已被广泛用于检测核酸[11],其中,所述核酸外切酶III信号的放大是在最近années.Cette策略中使用的一个敏感的检测方法是简单,易于受孕,外切核酸酶III不需要特别识别。网站,作用于双链DNA,逐渐沿着催化3“端除去单核苷酸的和是不活动的VIS-à-VIS双链DNA突出端或单链DNA [12]。荧光检测方法灵敏度高,操作简便等优点,在许多领域得到广泛应用。前,用于检测病原性细菌的基因的生物传感器的荧光通常仅产生一个信号,这只能的基础上增加了检测信号的(信号上),或者基于在检测信号的减少(可能发生信号关闭)和误报或漏报。试结果[2,5,8,9,13,14]。有两个荧光检测信号的生物传感器的比率可以克服上述缺点。分子的存在增加了荧光团的信号和来自其他荧光团,这不仅提高了检测灵敏度,但也检测[14-16]的特异性降低的信号。共振原理通过荧光能量转移(FRET)已被广泛用于检测DNA [8],[14,17] RNA,金属离子[18],双酚A(双酚A) [19],细菌[20]等,是在生物,食品和医药等领域具有重要意义。20]在这项研究中,基于外切酶III的信号的放大类型的荧光生物传感器比已被开发用于检测基于所述速率细菌pathogènes.La检测策略基因具有改进的灵敏性和选择性检测。立的检测方法是对食品安全等方面的监督。
有良好的应用前景。验仪器和试剂:Lumina的荧光分光光度计,紫外 – 可见光分光光度计EV300物(Thermo Scientific,USA),高速离心机5804R仪(Eppendorf,德国),成像系统凝胶BIO-RAD ChemDoc XRS(Bio-Rad公司,美国)),Milli-Q超纯水系统(Millipore,USA)。酸(醋酸),盐酸,氯化钠(药用酸4-hydroxyéthylpipérazinéthanesulfonique(HEPES),酰胺,钠乙二胺四乙酸(的Na 2 EDTA·2H 2 O),硼酸(Sigma-Aldrich公司,美国),过硫酸铵,SYBR金(北京Solabao技术有限公司),外切酶III,NE缓冲液1(New England Biolabs公司,USA)。试剂均为分析纯,实验超纯水为(> 18.25MΩ.cm),所有氨基酸序列核酸是由上海生物科学株式会社合成,并且在表1中。验方法在DNA浓度表示为单链的。NA的吸光度的浓度DNA的浓度的测定序列在260nm处用可见分光光度计UV根据朗伯 – 比尔(A =εbc)(ε260纳米[L /(摩尔厘米)]测定并计算DNA浓度为:a = 15400,G = 11500, C = 7400,T = 8700)最后,制备10μmol/ L溶液并在20℃下储存直至使用。20%中性聚丙烯酰胺凝胶上电泳。终DNA浓度为300nmol / L,施加电压为110V,持续2小时。聚丙烯酰胺凝胶用SYBR Gold染色30分钟,然后胶凝。样品进行10微摩尔/ L,R 1和10微摩尔/ L R2测试,附着在缓冲器1中的体积,放置在一个棕色离心管中的1.5mL,加热到95℃,持续5分钟并缓慢冷却至室温(冷却时间至少3小时)。R1和R2序列充分杂交。合R1 / R2(终浓度为100nmol / L),不同浓度的测试样品(LAC Z)与10单位外切III的,加入20微升10×NE缓冲液1,使终体积达200的最终体积微升。

育在37℃,80分钟的酶水解,在80℃下失活enzyme.Après将混合物冷却至室温下孵育,所述荧光发射光谱在激发波长测得的512纳米。谱范围在532和750nm之间。发和发射槽的宽度为20nm。试样品数次测量3次。果和讨论供体 – 受体对与检测原理有效能量转移要求供体的发射光谱与受体的吸收光谱重叠,能量转移的效率是密切相关的在供体和受体之间的距离处。通常发生在10纳米[22]。这项研究中,Cy3和Cy5被选择作为供体和能量受体的能量转移荧光共振为了检查能量转移荧光共振是否可满足在本实验系统中,频谱测定Cy3和Cy5的吸收和发射。图1所示,Cy3标记的最大激发波长为512纳米,激发的波长下,在558纳米的Cy3发射波长峰,而Cy5的吸收波长范围在532和750nm之间。射波长为671nm。Cy3发射光谱与Cy5的吸收光谱重叠。可以看出,荧光共振能量转移可以Cy3和Cy5,它们分别[23]是供体和受体,之间发生。光共振能量转移的效率与荧光供体受体之间的距离密切相关[24]。于控制DNA的距离的能力,Cy3和Cy5是在不同的DNA序列分别标示,并供体和受体之间的距离可以通过调节序列的碱基数来调节DNA。这项研究中,大肠杆菌基因(LACŽ基因)被用作模型靶分子和检测原理在图2A中示出。DNA序列(R1),其是对病原体基因(LAC Z)标记有在5“和R 1形成用部分其DNA序列的双链DNA(R1 / R2)Cy3染料完全互补互补(R2),并标记R2序列的3’末端。

一种Cy5染料。R1 / R2双链的形成近似于Cy3和Cy5,从而形成有效的荧光共振能量转移系统。R1 / R2的3’端突出,有效防止Exo III降解。激发波长激发Cy3的情况下,由于FRET效应,检测到Cy5的发射光谱。与lacŽ基因的存在,因为R1在其结合能力R2结合到LAC Z,紫胶Ž引起的链置换反应诱导的立足点[25],和LacŽ需要R1 R1。双链/ R2取代以形成双链结构R1 /紫胶Ž钝在R1的3”端,如Cy3标记或Cy5的路程,FRET效应之间的荧光对是由于距离增加而丢弃,Cy5随着Cy3荧光信号的增加,荧光信号强度降低。另一方面,在双链形成R1 /紫胶Z,R 1具有在端部3。这种情况下,钝端,EXO III能够降解R1,释放Ž湖和紫胶ž释放可以再现R1 / R2。转移反应,恒温阀芯从而从游离的Cy3连续启动循环反应产物,从而使Cy3的荧光信号的增强被进一步放大和Cy5的荧光信号被进一步降低。于所述两个荧光信号的强度的比率,细菌病原体基因的高检出率最终达到。了验证该原理的可行性,确定了反应体系的荧光光谱。图2B所示,在R1和R2的存在下,分别,系统被激励的用于Cy3和含有R1的系统(用Cy3标记)512纳米的激发波长仅检测荧光响应Cy3(最大发射波长为558nm)。2B中的A),而含有R 2的系统(用Cy5标记)不具有显著荧光发射响应(图2B,b)中,同时在558处处的激发,Cy5的具有在671nm处的强荧光响应(图2B,b)图2B,d)。成双链R1 / R2后,Cy3和Cy5接近这一点上,在512激发纳米减少光从射出Cy3的强度和增强从Cy5的发射的光的强度(图图2B,c)证明了Cy3和Cy5之间存在这种情况。光共振能量转移[24]。入形成通过外切III降解,从而使恢复的Cy3的荧光发射强度的细菌基因的病原菌的紫胶Z,R 1在R1 /紫胶Z和的强度后Cy5荧光发射减少(图2B,e)。述实验结果证明了所设计的检测策略是可行的。过聚丙烯酰胺凝胶电泳进一步证实DNA序列之间的相互反应。图3所示,信道1到3分别是湖泊Z,R1和R2,R2和腹板是略微有色的,也许是因为二级构象产生着色差SYBR金。个新的条带出现后R1和R 2形成的双链R1 / R2(泳道4),该结构R1 / R2不满足外切III的酶裂解的条件下,它仍然存在于双链形式加入后Exo III(第8行)。胶ž添加到反应R1 / R2(泳道6)中,R1 / R2带消失,带出现在R2位置和其他条带出现在新的位置,双链R1相同的位置/ LACž 5),这表明与lac Z具有管理移动R1 R1 / R2以形成双链R1 /紫胶Z.在此基础上,加入外切III和宽频带出现在酶的作用(第7道)。Z和R 2为邻近湖泊的位置(泳道1,3),由此得出的最宽的带是湖。Z和R2重合的结果。验结果上述显示如预期,再次表明设计了实验的可行性时发生的DNA链之间的相互作用。验条件为了优化能量供体和受体之间的距离在能量转移荧光共振[26]的效率至关重要的作用。此,通过改变DNA序列的碱基数来优化Cy3-Cy5之间的距离。该实验中,T0R2,T5R2和R2 T20R2具有不同链长被设计(请参阅特定序列表1)。DNA R1序列与上述的DNA序列杂交的充分形成双链R1 / T0R2和R1 / T5R2。
R1 / R2和R1 / T20R2,Cy3和Cy5由0,5,10和20个碱基分别分离。过Cy3标记的激发波长激发,检测比是如图4A所示的Cy5和Cy3(F671 / F558)的最大发射波长之间的比率,是因为分离距离的差异。的碱基数为10,F671 / F558达到最大值,也就是说,Cy3的Cy5的到具有荧光共振能量,这允许选择的距离的最佳传输效率Cy3和Cy5之间的10个碱基用于以下实验。它实验表明,Cy3的-Cy5的荧光信号是相对稳定的,并没有容易被缓冲液(图4B)的影响。此,该研究为Exo III选择合适的缓冲液NE 1(pH 7.0)作为反应缓冲液。了获得最佳测试结果,Exo III剂量和检测系统中的反应时间已经过优化。果表明,外切III的量对所述测试图案[10.27至29]的扩增显著效果。着Exo III剂量的增加,F558 / F671呈上升趋势(图4C)。酶用量为10 U,F558 / F671达到最大值,并且当酶剂量为20 U,F558 / F 671没有增加更多。了降低成本和保证检测效果,10U被选为酶反应外切III的在下面的实验的最佳量。应时间是影响酶促反应效果的重要参数之一。图4D中所示,F558 / F671逐渐当反应时间为80分钟延长的反应时间的增加,F558 / F671已经达到最大值,表明反应已达到平衡80分钟后。了确保酶促反应和检测的有效性,我们选择了80分钟,作为最佳反应时间为酶反应外切III。用生物传感器比率在上述优化实验条件致病菌的高度敏感的基因的检测,紫胶ž基因(大肠杆菌基因)作为靶基因的定量检测。种浓度的靶基因,lac启动Z,已被添加到该检测系统construit.Au如紫胶Z的浓度的增加,紫胶z为与更多的R1结合以形成双链紫胶Z / R1平端,从而允许所述酶的外切III降解,相应的Cy3荧光信号的强度增大和Cy5信号的荧光的强度降低,并且所释放的紫胶Z可以被R代替,以形成一双链Z / R1湖,从而提供信号变化放大(图5A)。用F558 / F671在纵坐标和紫胶的Z在散点图为横坐标和线性拟合的浓度,F558 / F671而lac Z的浓度是在10〜2000皮摩尔/ L范围内的线性(图5B)为回归方程为Y = 0.76486 0,00428X,相关系数R2 = 0.9991,检出限(LOD)的方法的限制是5.29皮摩尔/ L,由下式计算S / N = 3.与文献[8,30~32]相比,该方法具有更好的检测灵敏度。检测方法的特异性是通过使用构造成检测所述检测方法的特异性的生物传感器比率,和病原性基因的其他序列(NUC基因A(金黄色葡萄球菌),[33]基因INV确定(沙门氏菌)选择[9]中,EAE基因(大肠杆菌O157:H7)。13]和MEC的A基因(金黄色葡萄球菌)[8])都被检查。图6A中所示,仅与靶基因紫胶Z具有引起在信号和构造没有对其它致病基因响应,显示它有良好的选择性为基因紫胶Z.此外,该检测系统显著变化,内置生物传感器具有良好的区分基本不对称性的能力。图6B中所示,所造成的DNA序列(M1)单片不对称的信号检测系统是比由所述目标基因的信号变化显着更低的,以及与两个碱基不兼容( M2)和三主不匹配。DNA(M3)和四个不对称(M4)序列导致荧光信号的较弱修饰。论基于外切核酸酶III信号扩增的比例型荧光传感器已经到位。可用于高灵敏度和特异性地检测病原菌的基因。过调节DNA序列,(的Cy3的Cy5)夫妻荧光受体/供体之间的距离被控制,最佳距离被确定,共振能量转移的效率提高,并且提高检测灵敏度。振能量转移生物传感器的构造具有一定的参考重要性。酶促切割信号周期的扩增策略相结合,检测灵敏度进一步提高,LD的值是5.29皮摩尔/ L内置生物传感器具有良好的特异性,并且可以区分不同的疾病基因和不同的碱基错配序列。比例的生物传感器的结构也有助于降低检测系统对外部环境的影响,从而提高检测精度。方法为检测食源性致病菌的高灵敏度和高特异性提供了有用的参考。考文献Wang Y,Salazar J K.,Rev。品科学,F.,2016年,15(1):183-205 H.廖Y,周XM兴D.硬件接口应用ACS,2014年,6(13):9988-9996 Scallan E,胡克斯特拉RM,安古洛FJ ,RV Ratee,MA Widdowson,Roy SL,Jones JL,Griffin P M. Dis。染。102-103 Zunabovic先生,Domig KJ Kneifel W.:在2013年佐治亚大学,2015年相关的植物病害DIS 2011,17(1)7-15 A.马丁内斯 – 埃斯皮诺萨格鲁吉亚的损失估计TECHN,LWT食品技术,2011年,44(2)。51-362卓1H,J肛门Irudayaraj。Bioanal.Chem,2013,405(10):. 3313-3319李FQ,俞ZG,曲-HC,张GL,严H,刘X,他X J. BIOSENS。ioelectron,2015年,68:78 -82 JY时,陈CY,庞Y,叶WW,田楼吕Ĵ,张Y,杨M. BIOSENS,Bioélectron,2015年,. 67:595-600严YR,丁SJ丹Z,R元,张YH,代表W.程科学,2016年,6。8810刘于飞,薛锦涛,闫会娟,杨丽娟,刘炜,SUN Xiang-从。国J.肛门。学。017,45(3):303-308俞飞鸿柳,薛主席陈惠娟燕杨丽娟,刘炜孙祥德,分析化学,2017年,45(3):303-308 Souii A,MB我hadheb-加尔比加尔比J.食品科学,生物技术,2016年,25(1)11-20 YD孙鹏。P,Guo RY,Wang HH,Li T. Biosens。ioelectron,2018,104:32-38陈SH,吴VCH,闯YC,C.林SJ,微生物学方法,2008,73(1):7-17 Cheglakov。Z,Cronin TM,He C,Weizmann YJ Am.Chem。Soc。2015,137(19):6116-6119 Lu HZ,Xu S F. Biosens。ioelectron,2017年,92:147-153泉K,黄Ĵ,羊H,羊YJ,应L,王H,解NL,或M,王KM分析化学,2016年,88(11):。857-5864杨YJ,黄Ĵ,杨XH和Quan K,王H,鹰L,谢NL,或M,王ķJ.化学会志,2015年,137(26):. 8340-8343杨YJ,黄Ĵ,杨H,K泉谢NL,或M,唐JL,王K,M。学。COMMUN,2016年,52(76):. 11386-11389朱YY蔡YL,徐LG LX峥,王ML,齐B,C L.许ACS申请接口2015年,7(14):7492-7496晋BR,王SR,林男,金Y,张SJ崔XY,龚Y,李根蟠,徐楼鲁牛逼J. BIOSENS。BioélectroN,2017年,90:525-533桑托斯MCD,希尔德布兰德N. TRAC-趋势分析化学,2016年,84 60-71 JY施,田楼吕Ĵ,羊J.母校,化B,2015年,3(35):6989-7005佳XT,QQ陈,杨YF,恒温阀芯唐Y,王睿,徐YF,朱WP,钱X HJ,化学。Soc。2016,138(34):10778-10781坎宁安。PD Khachatrian甲Buckhout白色S,JR德尚,戈德曼ER,IL Medintz,Melinger SJĴ物理学化学。B,2014年,118(50):14555-14565许YY,周WJ,周男,项Y,R圆,Q.ý柴BIOSENS。ioelectron,2015年,64:306-310马PC,张H.,陈S,梁C,施C.分析师,2016年,141(10):2883年至2886年聂HJ,HF黄,李伟,杨T.肛门。SCI,2016年,32(11):。245年至1250年召H,马QJ,吴XX,X.诸分析。ACTA 2012,727(10):67- 70刘ZC,张L,张YM,RP梁,邱ĴD.桑斯。动器B,2014年,205(205):219-226洛艾萨AA CAMPUZANO S,M围城,PingarrónĴM. Talanta,2007,73(5):838-844刘XQ,王楼,蓝染楼Yehezkeli O, Willner IJ Am.Chem。
SOC,2013年,135(3 2)。1832-11839青木男,道H.分析员,2007,132(8),784-791科斯塔AM,凯我帕拉迪诺S. DIAGN微生物..感染。Dis。2005,51(1):13-17
本文转载自
恒温阀芯 https://www.wisdom-thermostats.com
